В оригинальной серии даётся ответ на вопрос, откуда у джедаев взялась целая армия клонов. Однако, не даётся вопрос: а как джедаи смогли снабжать милли...

Ганондорф похитил принцессу Зельду, чтобы заполучить часть трифорса, запечатанную в ее душе. Параллельно с этим далеко в будущем храбрая Линкл приходи...